由于粘膜平常受到的刺激少，使得粘膜的神经感觉过于敏感，性生活时与摩擦一触即泄，还会产生性交痛等。还因早泄、炎症、阳痿、不射精等降低精子活动力和精液粘度造成不育。

在青春期由于头被包皮紧紧包住，得不到外界的应有刺激，的发育受到束缚，致使发育成熟后头冠部直径小。成年后如发生包皮嵌顿包茎，严重者可导致坏死。所以外国在小孩3岁左右即进行包皮切除。

包皮内丰富的皮脂腺产生大量的分泌物，包皮使分泌物不能排出，堆积成垢寄生很多致病菌。病菌侵犯尿道可造成尿路感染，可引发包皮炎、炎、尿道炎，还可增加生殖器疣病、疱疹等性疾病的感染。

由于炎症等引起尿道口或前尿道狭窄影响尿液代谢，包皮内病菌上行感染肾脏，长期将能会损害到肾脏的功。研究表明，包皮垢是一种致癌物质，是导致男性癌的因素之一。据调查，85%-95%的癌患者，都是包茎或包皮过长。

男性的包皮垢（残余尿液结晶）是女性子宫颈癌的重要原因之一。包皮垢中饱含各类细菌，性生活中带入后致使女方妇科病反复感染久治不愈，刺激子宫，诱发子宫颈癌，是女方宫颈恶变的重要病因。